底层逻辑是因果报应，也就是new·三国的天意机制，多行不义必自毙会被hand·of·世界意志修正，所以与其创造因果不如成为因果，善恶之辩实际并不玄奥

第三部的藤木户最终找到了属于他的答案

顺带一提第三部的最终boss就如你所说的想要终结末法之世，做他认为的对世界有善的事；然而藤木户是这么对他说的：
「……人类尝过的，彼岸的酸辛吗」正在茶道呼吸的死神开口说道。「当然彻头彻尾地不了解，也没兴趣了解，但是侬了解汝的行径，忍者哟」

柴：think！我要防治忍者，你要杀忍者，我们都要减少忍者的数量，为什么不乖乖让路，think！
tmh：忍者...杀无赦...

无需判断，一并杀了即可

藤木户自己会成为自己的缰绳，而且作为忍者杀手事情会更加简单，杀掉理不尽的忍者便是。叔叔不是忍者杀手后就减少干预世人了，会自己判断杀不杀忍。当然真忍者复活后干的事太出生了，叔叔忍不了一点继续杀忍者了。

天下•宗派给了你多少钱？