南校区在大学城，一个小岛上，番禺区小谷围岛
北校区在天河区五山
计算机、软件、环境、法学、经贸、生物、艺术等学院在南校区
其它学院在北校区
大部分新生大一期间都是在南校，大二迁往北校
也有部分大一新生直接在北校
学院在南校的，学生四年就全部在南校上课。