虚云法师自此后，一心向佛，遍游各地的名山古刹。他27岁时离鼓山，先后在浙江天台山、普陀山、天童寺、阿育王寺、杭州三天竺、常州天宁寺、镇江金山寺、扬州高旻寺，从佛门老宿研习经教，参究禅宗。在几年的时间里，先后跟从过融镜、敏曦、天朗、观心、大定、朗辉等。法师虽出身富贵，一朝勘破红尘，皈依佛门，参悟佛理，这一切都未妨碍他以平常心来看待生活。为报父母的养育之恩，虚云法师曾三步一拜，以人所难能之笃志苦行从普陀山一直朝拜到山西五台山，历时三年。途中风霜雨雪，疾病饥寒，行人之所难行，忍人之所难忍，艰苦备尝，方圆成这深心大愿。这以后，法师又参访了陕西终南山、四川峨眉山、拉萨三大寺，并由西藏至印度、锡兰、缅甸等国，又朝礼各国的佛迹。后由缅甸回国，又朝拜了云南的鸡足山，经贵州、湖南、湖北等地，朝拜安徽九华山，再到扬州高旻寺参加禅七法会。在禅七中，法师心境寂然，能所双忘。某一日因开水溅手，茶杯坠地，一声破碎，悟透禅关，从此禅业大增。
在虚云法师的一生中，有一情同手足的莲友，他就是戒尘法师。他们二人是1901年结为同参的，1903年，二人同时离终南生，朝峨眉，后到鸡足山。虚云法师在昆明江南会馆闭关，戒尘为护关，三年以后出关，又回到鸡足山。虚云法师住持鸡足山的钵盂庵，改建十方丛林，由戒尘襄理寺务。

法师一生大慈大悲，度生无倦，常能在紧要关头临危不惧，智勇双齐，从容镇定，建寺安僧，功德无量。1911年，革命军兴起，革故鼎新，当时李根源任云南省革命协统。李一向厌恶诸方僧徒不守戒律，于是就率兵进驻鸡足山悉檀寺，把金顶鸡足大王铜像及佛殿都捣毁，并指名要缉捕虚云法师问罪，虚云法师不顾个人的安危，直接来到军门，同李根源进行辩论，终于使李开颜致敬，停止了毁寺逐僧的行为。以后李氏皈依佛教，数十年护持法门，老而弥笃。事隔四十年后，虚云法师又一次面临危难，然而法师以他自己多年修行的功力，不惊不怒，从容笃定，度过了历时三个月的“云门事变”。1951年春，云门准备春期传戒，各地闻讯前来求戒的人很多。当时正值全国“镇反”运动开始，湖南某县有血债的反革命分子混进其中，湖南的公安部门追到云门，将其捉拿归案，由于这个原因，引起乳源地方当局对云门寺新老僧众产生怀疑，甚至误传云门藏有军械、电台。地方当局于农历二月二十四日派出百余人，于午斋时抵寺，将寺院团团包围。在寺院左右及后山高地，都架起了机枪，对准寺内，如剿大敌，气氛极为紧张。当时全寺僧人百余人正在斋堂用饭，都不许离座。为搜寻军械、电台，所有殿堂房舍都一一细查，最终一无所获。对于所有稍有可疑的人员，都一一叫出来问话，一直到掌灯时分才离开。这件事一直到农历五月二十三日 ，京穗调查组到寺，一场镇反扩大化事件才告平息。在“云门事变”中，前后被拘禁的僧人有二十六人。在这期间，全寺僧众百余人集中禁闭于禅堂十八日，饮食睡眠均在其中，大小便都有军警看守。由于地方当局对云门寺的情况作出了错误的估计，认为虚去法师和绝大多数僧人都是“反革命”，以致对法师也施了种种无礼的手段，使他的身体受到了严重的摧残。事变平息后，农历六月下旬，虚云法师抱病为远道前来求戒者传授三坛大戒，这是云门复兴后第一次传戒，虽然受戒人数不多，由于天气酷热，戒期的时间也不长，但风波已平息，人心安定。参加受戒大会的人深怀希有之心，难遭之想，实非平时传戒法会所能比喻。

虚云法师于国难当头之际，总是尽自己所能，助国家百姓。1936年，全国处于抗日救亡的紧急关头，当时法师正在曹溪主持南华寺，他提议全寺大众减省晚食、节积余粮，献给国家救助灾民。l940年，广州沦陷，1941年，曲江县严重缺粮，饥民甚多，虚老就将各方供养20多万元，全部交给广东省政府作为赈济灾民之用，1942年冬，国民政府主席林森派屈映光到广东，请虚云法师赴重庆主持“护国息灾法会”1943年1月26日 法会圆满，法会历时3个月，期间名公巨卿赠给虚云法师的名贵古玩及字画共5大箱，在归途中，他把这些东西全部分赠给各地寺庙，自己不留一物。侍者问及此事，虚老回答“徒费保存，徒乱人意”。
虚云法师虽是禅宗大德，平生亦以振兴禅宗为己任，可他的思想并不偏狭，其特点是宗教并重，禅净并重，解、行并重，内外并重，他在谈到佛弟子如何适应时代的问题时认为，除戒定慧不能改动以外，佛弟子的日常生活，衣食住行都可以改变。既然中国佛教与印度相比，时间、地点、条件都变了，则佛教中的若干生活习惯，也应因时制宜。虚云法师的思想，以此可见一斑。

师父，我们这一次次的人生，走了又来，来了又去，到底是为了什么？好想你。

迷于嗜欲，乱于声色，谓之 “倒置之民”。
其寐也魂交，其觉也形开，与接为构，日以心斗。
近死之心，莫使复阳也
小人则以身殉利，愚者则以身殉欲。其嗜欲深者，其天机浅。
——《庄子》人生在世，贵尽忠孝节义等事，方于人道无愧!可立于天地之间；
若不尽忠孝节义等事，身虽在世，其心已死，是谓偷生。
——《关圣帝君觉世经》
在道教，有内功和外功的修持。
外而积德行善，功德不够，上天不付大道。
内而明心见性，性不固，一己私欲，大道不存。
修仙之要，有内功，有外功。
内则涵养神气，外需济世利人。
出此两句，恐仙道难成。
修行人以济世度人为己任。
修的好，人见了你，都会有修行之心。
所谓行不言之教，非虚言。
人于世间无功，于玄门无行，而妄想成仙得道，每每打坐，反顾一己之私，安得到头!
神仙，不是小说里随性杀戮，广开后宫，全知全能的存在。
仙之为仙，因其体合大道，德配天地，清轻上升，游乎清虚碧落。有一毫私心杂欲，只名凡夫。大道至简至易，修仙之法无他，观天之道，执天之行，尽矣。慈心于物，积功累行，修身养德，就是筑基。世人种种嗜欲，贪求，情欲无度，见利忘义，只会重浊下降。心神浑浊，打坐万年，亦只是磨砖作镜，不得超凡入圣。
神仙本是凡人做，只怕凡人心不坚 举世无人肯立志，立志修玄玄自得仙家作用，并非神奇。以平常之道，行平常之事，为平常之人而已。孔子云：庸德之行，庸言之谨。天上神仙，乃世间庸人也。
习气太甚，大足为学道之累，宜时刻扫除之。古圣惩忿室欲四字，决定离他不得。和以处众，宽和以乐群，寡言以养德，常定以安心。一切恶习，荡涤殆尽，便是一位在世仙人。故上士学道，体之于身，中士学道，索之於言。下士学道，求之於术。
——《唱道真言》
道者，天道也，天道无亲常与善人。是故修道者必先修德。外而积功累行。广行方便，济人之难，救人之急。待友至诚，奉亲无怨。一言一行俱有裨益于世道，一颦一笑全无半点私心。内而明心见性。太上忘情，
对境无心。炎炎沙土，焦天烁地，而我心清凉自在，如一滴杨枝露水，自然返观内视，仙阶有路。
一朝悟道，必假十年苦修
先抛世事如弃履，再抛性命于两端
存抱道而亡之心，怀度尽众生之慈
世之修道者，多逞口舌功夫，自视甚高。为名为利，费尽心机。于道何益，到死无成
道士为修行而出家。不为名利。受十方供养，必需有十分之功德。不然日后阎王老子自有看顾。
出家弟子，传一教之法脉。居庙宇，护道场，教化愚迷。清口茹素，种种戒律，演经诵咒，不贪
世间享乐。
若图清静，逃世事，择一地安居度日，则离道远矣。
闭门捉贼，守一己之私，怎合天道?更莫说为名为利