【火箭队】兰斯
兰斯初次登场于《金·银·水晶版》的播音塔事件中，当时他还是个无名的火箭队干部，只负责充当阻挡主角的沙包。
《心金·魂银》中将呆呆兽之井事件中的火箭队小兵和播音塔事件中的火箭队干部形象相融合，推出了兰斯这一形象。然后搞笑的来了：堂堂火箭队四干部之一，拿着8级的超音蝠和12级的瓦斯弹跑到桧皮镇割呆呆兽的尾巴，最后被初出茅庐的主角暴打一顿，逼格跌穿地心，白瞎这张帅脸了。
兰斯的名字来源于MGM-52 Lance，即“长矛”地对地战术导弹，它是美国陆军第二代地对地战术导弹。

【火箭队】拉姆达
相比于《金·银·水晶版》中毫无记忆点的兰斯，拉姆达给人的印象无疑深刻了很多。一个是主角要想通过火箭队基地剧情，就必须找到拉姆达的黑暗鸦，才能得到打开发电机房间的暗号“坂木大人万岁”。另一个是在播音塔剧情中，负责阻拦主角的拉姆达一口气放出了5只瓦斯弹和1只双弹瓦斯，可谓艺术达人。
拉姆达非常擅长变装，在《金·银·水晶版》中他变装成播音塔的导播，在《心金·魂银》中则是在火箭队基地变装成了坂木。拉姆达在动画《宝可梦 世代》中也有登场，不过光挨揍了，被阿渡的快龙扁完又被顽皮雷弹电，可谓惨绝人寰。
拉姆达的名字来源于Lambda 4S运载火箭，即日本的拉姆达运载火箭，日本利用其发射“大井”号卫星，成为继苏、美、法之后第四个发射卫星的国家。拉姆达运载火箭是固体火箭，技术较为简单，这也可能是游戏中拉姆达宝可梦配置的来源。

【火箭队】雅典娜
雅典娜初次登场于《金·银·水晶版》的愤怒湖事件中，当时她还是个无名的火箭队干部，不过立绘明显是女性。在击败雅典娜后，她承认让愤怒湖鲤鱼王强制进化的幕后黑手就是火箭队。在播音塔事件中，雅典娜再次登场阻挠主角。
雅典娜在《火红·叶绿》中也有登场，负责把守办公室大门。击败她后，主角能在仓库电脑中发现能令宝可梦强制进化的机器的企划案。
《心金·魂银》中雅典娜被设定成了有酒红色头发、眼神凶恶的女子，因此在同人创作中，就有了雅典娜是小银母亲的二设。
雅典娜的名字来源于Athena Rocket，即雅典娜系列运载火箭，是美国洛克希德·马丁公司研制的小型固体运载火箭，主要应用于商业卫星发射。

【火箭队】阿波罗
阿波罗初次登场于《金·银·水晶版》的播音塔事件中，当时他还是个无名的火箭队干部。阿波罗是率领火箭队残党占领播音塔的幕后推手，他企图在全地区播放火箭队宣言来唤回坂木。被主角打败后，阿波罗心灰意冷，解散了火箭队残党。
阿波罗在《火红·叶绿》中也有登场，不过当时他依旧没有名字。这时的阿波罗是火箭队在七之岛的支部领导，他一开始认为坂木被打败是主角散布的谣言，但是对战后他看见了主角的绿色徽章，意识到了这都是真的，于是暂时撤出了关都地区，并立誓要找到坂木重组火箭队。
通过《心金·魂银》时拉比事件中，我们可以得知在播音塔事件中，身处关东城都交界地区的坂木的确收到了火箭队残党的邀请，打算重出江湖回归他忠诚的火箭队。只不过主角恰好在时拉比的力量下与博士助手穿越回了过去，然后轻松拿捏了坂木苦练多年的46级尼多后（乐）。牢坂遂破防离开，在同一时间，阿波罗也破防解散了火箭队残党。
在《去皮·去伊》世界观中，阿波罗第四次登场，而且更加残忍、狡猾、野心勃勃。在火箭队基地剧情中，主角能听到阿波罗打算卖掉卡拉卡拉的头骨。主角登入名人堂后，阿波罗会留在基地与主角对战，他祝贺主角成为了冠军，但并不打算服输，而是想以这次失败为跳板进而创立一个更强大的火箭队，现在只不过是暂时撤出关都地区罢了。
阿波罗的名字来源于Apollo Program，即美国探索载人登月的“阿波罗计划”。

【熔岩队】火雁
火雁在三色宝石和宝石复刻中的人设和性格大相径庭，几乎可以看作是两个人。
在三色宝石中出场的火雁外形是黑发女子，性格相当狂野，在战斗过程中称呼主角为“兔崽子”，落败后又直言主角“强得令人想吐”。不过，黑发火雁的主要人气还是来自于衍生漫画《宝可梦 特别篇》，她与男主角路比之间喜闻乐见的互动，让无数小朋友觉醒了熊熊燃烧的御姐控和反派控，直呼顶不住。
在宝石复刻中出场的火雁则是改成了紫发的娇小女孩，身上穿的兜帽服也更贴近于小恶魔，走路时也会有节奏地左右摇头晃脑。只能说GF是懂的，在接受强气御姐洗礼后，小朋友又能与合法萝莉开心打交，顶得住顶不住啊？
宝石复刻一周目中，火雁在整个流程沉默寡言，说话中带有大量省略号。不过在二周目中，火雁因为赤焰松放弃理想而变得疯狂，违背指令私自行动，一方面抢夺超级进化需要的钥石，一方面夺取了得文公司的空间转移装置以阻挠破坏陨石的计划。最后在主角的铁拳矫正下，火雁哭哭啼啼地跑回了熔岩队基地，并得到了赤焰松的谅解，希望能帮助赤焰松创造新的开始（你宝特有的包饺砸结局.jpg）。
在动画《宝可梦 世代》中，基于宝石复刻形象的火雁也有登场。她被赤焰松命令留下来阻击佑树，在佑树带着王牌蜥蜴王赶到时，火雁捂嘴大笑，并满脸病娇地表示，自己现在只想好好“分析”一下佑树君~从此之后，在同人文创造中火雁开始与病娇挂钩，但凡开后宫收火雁的，基本上赤焰松都会被背刺得死无全尸（赤老师，你太弱了.jpg）。

【熔岩队】火村
熔岩队干部，烟囱山第一届斗狗大会主持人，在三色宝石里还是普通小兵脸，到宝石复刻中变成大胃袋了，被打败后还会愤怒地跺jiojio，震感不下于固拉多的断崖之剑。

【海洋队】阿泉
海洋队中对位火村的角色。她是海洋队的头脑，人前人后都很严肃，不过反而在氛围宽松的海洋队成员中有许多粉丝。在游戏流程中，她会和火村一样，劝说自己的首领及时收手，不要唤醒沉睡中的盖欧卡/固拉多。

【海洋队】阿潮
海洋队中对位火雁的角色。不过与火雁的理想主义不一样，阿潮在二周目选择继续计划的原因是水梧桐曾帮助过他，他将以水梧桐的理想作为自己的理想，为了实现理想不惜付出性命。
牢水：不是bro，我都选择金盆洗手过日子去了，你还要架着我搞事，你是不是练摔跤把脑袋练得尖尖的啊？

【银河队】伙星
伙星首次登场于山谷发电厂事件中，她率领银河队绑架了发电厂的员工和女儿，企图借此偷取电力。之后又在心齐湖登场，主角可以和博士助手联手击败她。一周目与伙星的最后一次对战是在枪之柱，她与岁星联手试图阻挠主角。
伙星的性格相当火爆，在发电厂事件中被主角打败后，伙星从此恨上了主角。在心之湖事件中，先赶到的博士助手不敌伙星，在主角出手时，伙星嘲讽主角着急忙慌地来救自己的小情侣，简直“不可原谅”。
二周目中伙星因为和冥王理念不合，选择退出和岁星一起银河队。离职之后，伙星有说过她会去毁坏的世界寻找赤日。不过，资料中显示伙星和岁星彼此仇恨。
另外，虽然没有官方背书，但根据立绘来看，伙星的祖先应该是100年前金刚队的场长火夏。

【银河队】岁星
岁星在百代大楼首次出现，当时她绑架了人力自行车店的店长，并强抢了他的宝可梦。之后又在睿智湖出现，并击败了主角的劲敌阿驯。一周目与岁星的最后一次对战是在枪之柱，她与伙星联手试图阻挠主角。
与脾气火爆的伙星不同，岁星的性格非常彬彬有礼，每次和主角对战结束后，都会说“失礼了”。不过，在枪之柱看到阿驯鼓起勇气选择再战后，还是非常罕见地哈气了。
二周目中岁星因为和冥王理念不合，选择和伙星一起退出银河队。不过，资料中显示伙星和岁星彼此仇恨。

【银河队】镇星
镇星在立志湖首次出现，他被跟主角击败后，透露出伙星在心齐湖。之后镇星又在银河队基地试图阻挠主角，被主角击败后，十分沮丧地说，赤日天冠山的打算自己完全不知道。
枪之柱事件后，主角可以在在银河队基地见到他。赤日消失之后，镇星在考虑银河队要前往的方向。他不清楚赤日完全的计划，但知道极端主义绝不是解决的方案。
在动画片《宝可梦 世代》中，镇星在银河队基地看着赤日被吸入毁坏的世界，却被赤日命令不要来找他。
另外，虽然没有官方背书，但根据立绘来看，镇星的祖先应该是100年前野贼三姐妹的老三阿梅。由于镇星的颜值在银河队三干部中是最出色的，他时常被误判为女性。

【银河队】冥王
冥王在资料片《白金》中才出场，也正是因为这个缘故，他在一周目剧情中多次与伙星一起出现，在山谷发电厂和心齐湖都有出场。主角在银河队基地击败赤日后，冥王目睹主角释放了湖之三神。
二周目中，冥王与岁星、伙星一起在严酷山登场，企图唤醒席多蓝恩。不过岁星、伙星当场宣布和银河队切割，冥王只能失落地选择独自进入严酷山深处，最后被赶来的国际刑警帅哥捕获。在整个游戏流程中，冥王也是银河队四干部中唯一没有和主角对战的人。
在银河百代大楼的洛托姆房间中，主角可以找到一本关于洛托姆形态的笔记和一本详写遇到洛托姆的日志，笔记的作者正是冥王。冥王表示，他在某地偶然得知了可以进出特殊马达的宝可梦洛托姆的信息，为此他将深入研究洛托姆，并独占所有的功劳。资料中显示，冥王曾在森之洋馆住过一段时间，或许他就是在那里遇到了洛托姆。
另外，虽然没有官方背书，但根据立绘来看，镇星的祖先应该是100年前祝庆村的杂货店老板晓白。晓白因为娶了洗翠银河队制造组组长桃发的孙女芸梨为妻，而被后者认定为“从他手中抢走孙女的恶人”，致使桃发对杂货店限制供货。在主角的斡旋下，桃发最后漏风的小棉袄下吃了一记百万吨重拳，泪奔而去。

【等离子队】罗德
在《黑·白》一周目中，罗德和魁奇思、斯姆拉在飞云市的等离子队藏匿之处里首次登场。随后他在Ｎ的城堡与其他五位贤人一起阻挡主角，但被随后赶来的道馆馆主们拖住。罗德的名言是“君子喻于义，小人喻于利”。
在《黑·白》二周目中，罗德出现在１８号道路。他提到魁奇斯曾经环游世界各地，收集各种知识，寻找志趣相同的人。魁奇思在计划中提到要开发理解人类感情与心灵的能力，自己也正是因为这一点才选择加入等离子队，不过现在已经不清楚这到底是不是魁奇思的谎言了。罗德表示，如果有朝一日N能够人类的感情，自己也将率领等离子队再次集结，并直面魁奇思。最后，罗德被国际警察帅哥逮捕。
在《黑２·白２》中，罗德首次出现在帆巴市，为了赎罪，他和巴贝娜、荷莲娜一起在一间屋子里照顾和主人们失散的宝可梦。在对战中输给主角后，他把Ｎ的索罗亚交给主角，并提到N和传说的宝可梦一起踏上了旅途。主角在6号道路与勾帕路翁相遇后，罗德再次出现，并感叹魁奇思的野心与恶意越来越扭曲。
在巨人洞窟中，罗德集结原等离子队阻拦新等离子队，并指出魁奇思的目的是统治合众地区，解放宝可梦不过是他的说辞罢了。在主角击败酋雷姆后，罗德与走出等离子舰的阿克罗玛相遇，阿克罗玛将人与宝可梦牵绊的答案告诉了罗德，罗德在确认N平安无事后，怀着感激之心解散了等离子队。